O curso possui duração de 5 anos e inclui 262 créditos, sendo 186 em disciplinas obrigatórias e 76 em disciplinasa optativas. A formação científica é a mesma das outras engenharias: matemática, física e ciências da computação. Já a formação profissional de engenharia se concentra em controle dinâmico de processos, informática industrial e automação de manufaturas.

Basicamente, o curso dará ao profissional uma formação com conhecimentos gerais em Engenharia Elétrica (circuitos, eletrotécnica, eletrônica digital); Engenharia Mecânica (desenho, materiais, elementos de máquina); Ciências da Computação (estrutura de dados, engenharia de software) e conhecimentos especializados em controle de processos, informática industrial e automação da manufatura; além de economia, gestão e segurança.

Apesar de amplo, o currículo de Engenharia Mecatrônica procurou obter um equilíbrio entre mecânica, elétrica e computação e as disciplinas optativas que complementam a formação são integradas em uma especialidade, de forma a que o aluno possa optar pela especialidade desejada. Algumas das disciplinas optativas oferecidas são: introdução à robótica, controle inteligente, visão por computador, automação industrial, sinais e sistemas discretos, dinâmica e controle de robôs e sistemas mecatrônicos.

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